С 1965 г. общими вопросами охраны природы в Испании ведает Научная комиссия по охране природы. В Испании существуют две основные категории охраняемых территорий — национальные парки и заповедники (или природные парки). В 70-х годах в стране насчитывалось 6 национальных парков и один заповедник общей площадью более 444 тыс. га. Почти все национальные парки расположены в горных районах северной Испании и на Канарских островах.

Первым в стране заповедником (или резерватом со строгим режимом охраны) стал Кото-Доньяна. Заповедник расположен на правом берегу р. Гвадалквивир у ее низовьев. Этот район известен как ландшафт «марисмы» (т. е. солоновато-водных приморских болот южного типа с исключительно богатой флорой и фауной), По своим природным условиям он очень напоминает низовья р. Волги. Природные особенности заповедника Кото-Доньяна сделали его идеальным местом обитания самых разнообразных видов животных.

В заповеднике встречаются такие виды животных, как кабан, косуля, лань, олень, рысь, виверра, а из птиц — рыжий кеклик (каменная куропатка). Однако настоящим «кладом» заповедника является его богатейший орнитологический мир, особенно водоплавающие птицы. Только здесь встречается теперь особый редкий вид фазана (Francolinus), a также «морские ласточки», некогда очень распространенные на Пиренейском полуострове. В Кото-Доньяна обитают очень редкий стервятник, беркут, черноголовая славка, коричневый козодой, ястреб, орел-могильник, турач и живет огромная колония цапель.

В прибрежных водах Испании, особенно в многочисленных глубоких эстуариях полноводных рек северо-запада, обитают представители морской фауны. В атлантических водах промышляют сардин; в меньшей степени ловят мерлуз, бонито, анчоусов, салаку, треску и разнообразных моллюсков. Прибрежные воды Средиземного моря менее благоприятны для обитания ихтиофауны. Здесь наиболее распространены тунец, лосось, анчоусы, а также раки, лангусты и др.